发表论文：
1. Xiheng Hu#, Wensheng Shi#, Liang Dong, Lingjuan Huang, Xiyuan Zhang, Yiting Feng, Jie Sun, Lanlan Liu, Teng Liu, Jun Fu, Bowen Zhong, Qihao Leng, Xiaohua Wu, Minfeng Chen, Lingfang Li, Yuan Li, Xin Jin, Long Wang, Jian Cao, Xin Li*(李鑫), Mingzhu Yin*, Xiang Chen*. Decoding the Cellular Heterogeneity and Malignant Progression of Human Penile Squamous Cell Carcinoma by Single‐Cell RNA Sequencing. Advanced Science, 2026（JCR 一区，共同通讯作者位列第3） IF:14.1
2. Xu Pan#, Xin Li#（李鑫）, Liang Dong#, Teng Liu, Min Zhang, Lining Zhang, Xiyuan Zhang, Lingjuan Huang, Wensheng Shi, Hongyin Sun, Zhaoyu Fang, Jie Sun, Yaoxuan Huang, Hua Shao, Yeqi Wang, Mingzhu Yin*. Tumour vasculature at single-cell resolution. Nature, 2024（JCR 一区，共同第一作者位列第2）IF:50.5
3. Xin Li#（李鑫）, Xiyuan Zhang#, Shuang Zhao#, Shiyao Pei, Jie Sun, Liang Dong, Xu Pan, Wenhua Wang, Hao Liu, Yaoxuan Huang, Teng Liu, Jinhai Deng, Chunlan Hu, Chao Lv, Juan Su*, Mingzhu Yin*, Xiang Chen*, The dynamically evolving cell states and ecosystem from benign nevi to melanoma. Clinical Cancer Research, 2025（JCR 一区，第一作者）IF:10.0
4. Wenhua Wang#, Xin Li#*（李鑫）, Rui Hu, Liang Dong, Shiyao Pei, Liping Jin, Qian Gao, Xiang Chen*, and Mingzhu Yin*, BET inhibitor in combination with BCG vaccine enhances antitumor efficacy and orchestrates T cell reprogramming for melanoma. Cell Reports Medicine, 2025（JCR 一区，共同一作排名第2兼共同通讯作者）IF:11.7
5. Xin Li#（李鑫）, Shuang Zhao#, Xiaohui Bian#, Lining Zhang, Lixia Lu, Shiyao Pei, Liang Dong, Wensheng Shi, Lingjuan Huang, Xiyuan Zhang, Mingliang Chen, Xiang Chen*, Mingzhu Yin*, Signatures of EMT, immunosuppression, and inflammation in primary and recurrent human cutaneous squamous cell carcinoma at single-cell resolution. Theranostics, 2022（JCR 一区，第一作者）IF:12.4
6. Lingjuan Huang#, Xianggui Wang#, Shiyao Pei#, Xin Li#（李鑫）, Liang Dong, Xiaohui Bian, Hongyin Sun, Liping Jin, Huihui Hou, Wensheng Shi, Xiyuan Zhang, Lining Zhang, Shuang Zhao, Xiang Chen, and Mingzhu Yin*, Single-Cell Profiling Reveals Sustained Immune Infiltration, Surveillance, and Tumor Heterogeneity in Infiltrative Basal Cell Carcinoma. Journal of Investigative Dermatology, 2023（JCR 一区，共同一作排名第4）IF:5.7
7. Xin Li#（李鑫）, Xu Pan#, Hanxiao Zhou#, Peng Wang, Yue Gao, Shipeng Shang, Shuang Guo, Jie Sun, Zhiying Xiong, Shangwei Ning*, Hui Zhi*, and Xia Li*, Comprehensive characterization genetic regulation and chromatin landscape of enhancer-associated long non-coding RNAs and their implication in human cancer. Briefings in Bioinformatics, 2022（JCR 一区，共同一作排名第1）IF: 9.5
8. Xu Pan#, Xin Li#（李鑫）, Jie Sun, Zhiying Xiong, Haoyu Hu, Shangwei Ning*, and Hui Zhi*, Enhancer methylation dynamics drive core transcriptional regulatory circuitry in pan-cancer. Oncogene, 2022（JCR 一区，共同一作排名第2）IF: 8.0
9. Xu Pan#, Caiyu Zhang#, Junwei Wang#, Peng Wang, Yue Gao, Shipeng Shang, Shuang Guo, Xin Li*（李鑫）, Hui Zhi*, and Shangwei Ning*, Epigenome signature as an immunophenotype indicator prompts durable clinical immunotherapy benefits in lung adenocarcinoma. Briefings in Bioinformatics, 2022（JCR 一区，共同通讯作者）IF: 9.5
10. Yue Gao# , Xin Li#（李鑫）, Shipeng Shang#, Shuang Guo#, Peng Wang, Dailin Sun, Jing Gan, Jie Sun, Yakun Zhang, Junwei Wang, Xinyue Wang, Xia Li*, Yunpeng Zhang*, and Shangwei Ning*, LincSNP 3.0: an updated database for linking functional variants to human long non-coding RNAs, circular RNAs and their regulatory elements. Nucleic Acids Research, 2021（JCR 一区，共同一作排名第2）IF: 19.16
专利：
1.基于组学测序的皮肤黑色素痣良恶性预测方法，实用新型，申请号：202410734657.4
2.基于AI技术的药物筛选方法、模型构建方法和装置，实用新型，申请号：202410734657.4
3.孕早期胎儿生物特征测量方法、装置、设备及介质，实用新型，申请号：202410877290.1
4.肺栓塞预测方法、装置、设备及介质，实用新型，申请号：202410877283.1
5.一种基于 AI 的可逆分子表征驱动型药物筛选方法及系统，实用新型，申请号：202510355263.2
6.一种衰老生物标志物及其应用，实用新型，申请号：202610140597.2
著作：
《肿瘤病理学与临床治疗》，编委，吉林大学出版社，2025
主持项目：
1.国家自然科学基金委员会（面上项目），基于大规模多模态数据的肿瘤脉管细胞表观遗传特征图谱刻画与调控机制研究（课题编号：32570799），2026.1-2029.12，50万元，主持，在研
2.国家自然科学基金委员会（青年科学基金项目（C类）），多组学解析皮肤黑素瘤微环境动态演变特征及发病机制（课题编号：32200523），2023.1-2025.12，30万元，主持，结题
3.中国博士后科学基金会（博士后创新人才支持计划，现“国资计划”A挡），黑素瘤恶性演变微环境动态图谱绘制及早期筛查分析平台开发（课题编号：BX20220352），2022.7-2023.5，23万元，主持，结题
4.重庆市科技局（新重庆青年创新人才），肿瘤微环境动态重编程与调控机制研究（课题编号：CSTB2025YITP-OCRCX0005），2025.11-2028.10，60万元，主持，在研
5.重庆市卫生健康领域国家级后备人才（优秀青年），2024.07-2027.06，100万，主持，在研
6.中国博士后科学基金会（面上项目），基于单细胞测序探究BET抑制剂联合卡介苗对黑素瘤的作用机制（课题编号：2022M713523），2022.6-2023.5，8万元，主持，结题
7.重庆市自然科学基金面上项目，BET抑制剂联合卡介苗对肿瘤微环境中T细胞的调控机制研究（课题编号：CSTB2023NSCQ-MSX0658），2023.8-2026.7，10万元，主持，结题
8.重庆市科卫联合医学科研项目青年（医师）科学家项目，单细胞大数据结合人工智能的肿瘤伴随诊断系统构建及应用研究（课题编号：2025QNKX004），2025.1-2027.12，60万元，主持，在研
9.重庆市教委科学技术研究计划重大项目，基于多组学大数据揭示多种类型黑素瘤微环境异质性及其调控机制研究（课题编号：KJZD-M20250010），2025.7-2028.6，10万元，主持，在研
10.中央高校基本科研业务费医工融合项目，泛癌脉管生成智能评估体系开发与应用（课题编号：2023CDJYGRH-YB05），2023.10-2025.9，25万元，主持，结题
获奖
1.2025年，新型BET抑制剂药物开发与转化，全国博士后管委办公室，第三届全国博士后创新创业大赛，铜奖（2/8）
2.2024年，1.1类原创新药NHWD-870，重庆市医学科技创新成果转化大赛工作组/重庆市卫生健康委员会国家职业技能鉴定所，2024年重庆市首届医学科技创新成果转化大赛，一等奖（2/3）
3.2024年，1.1类原创新药NHWD-890，重庆市医学科技创新成果转化大赛工作组/重庆市卫生健康委员会国家职业技能鉴定所，2024年重庆市首届医学科技创新成果转化大赛，二等奖（2/3）
4.2023年，基于AI技术的高精度药物设计和筛选平台的构建及应用，中国发明协会，一等奖（6/6）
5.2024年，Tumour vasculature at single-cell resolution，重庆市科学技术协会、四川省科学技术协会，第五届川渝科技学术大会优秀论文，特等奖（3/5）
