重庆大学附属肿瘤医院副研究员
学习经历
2005年9月-2010年1月 东南大学 生物医学工程 博士
1998年9月-2001年7月 兰州大学 细胞生物学 硕士
1994年9月-1998年7月 兰州大学 生物学 学士
工作经历
2016年1月-至今 重庆大学附属肿瘤医院 副研究员
2014年6月-2015年12月 重庆市人口与计划生育科学技术研究院 助理研究员
2010年8月-2014年5月 欧洲分子生物学实验室(EMBL,德国海德堡)博士后
2001年7月-2005年9月 中国药科大学 助教、讲师
研究方向
主要的工作包括主要包括用二代测序技术对癌症相关基因进行高通量靶向检测panel开发应用、遗传病(如青光眼)相关基因检测panel的研发和应用、ctDNA甲基化检测技术开发以及生物信息学新的算法、分析流程、大数据挖掘研究等。发表SCI论文14篇,申请和获得授权国家发明专利多项,获得多个纵向和横向研究课题。近期的研究领域为:(1)基于大规模基因组数据和临床表型数据的分析和挖掘;(2)创新技术的开发与应用,在多层次肿瘤组学(DNA、甲基化、表达、miRNA和蛋白质水平)的手段研究分子表型与临床表型之间的关系;(3)采用CRISPR-Cas9全基因组基因编辑等技术寻找放射治疗、药物敏感或抗拒基因以及作用机制研究。
教学课程
成果
一、研究论文
(1)Analysis of variants in Chinese individuals with primary open-angle glaucoma using molecular inversion probe (MIP)-based panel sequencing, Molecular Vision 2020; 26:378-391.(通讯作者)
(2)A fusion method based on alignment software with SNP and Indel detection methods. Combinatorial Chemistry & High Throughput Screening, 2022; 25(3):519 - 527(通讯作者)
(3)Analysis and Research on Key Nodes of Gene Expression Network Based on Complex Network, Complexity, Volume 2020 |Article ID 8816633 (通讯作者)
(4) Gene Position Index Mutation Detection Algorithm Based on Feedback Fast Learning Neural Network, Comput Intell Neurosci.; 2021 Jul 6;2021:1716182(通讯作者)
(5) Sequence Fusion Algorithm of Tumor Gene Sequencing and Alignment Based on Machine Learning; Comput Intell Neurosci. 2021 Dec 31;2021:9444194(通讯作者)
二、专利
(1)核酸靶序列捕获测序文库的制备方法,中国发明专利,201610185978.9(授权)
(2)基于长链分子倒置探针的核酸靶向捕获测序文库制备方法,中国发明专利,ZL2018101689912(授权)
三、项目
(1)基于高通量靶向测序的血浆miRNA检测技术研发及肺癌早期诊断模型建立, 2020年-2022年;重庆市科技局;负责人
(2) CTCFL通过DNA甲基化促进EMT过程增强肿瘤细胞放疗抵抗的机制研究,重庆市自然科学基金,第一参与人
(3) 多层次分子检测模型辅助诊断肺小结节恶性程度研究,2018-2021年,重庆市科技局;第一参与人
(4)肿瘤ctDNA panel研发,横向课题,负责人